Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL40Q9NQ50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL40Q9NQ50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms