Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRC4Q9NPP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRC4Q9NPP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRC4Q9NPP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms