Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREM1Q9NP99 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREM1Q9NP99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms