Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PREBQ9HCU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PREBQ9HCU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PREBQ9HCU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PREBQ9HCU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms