Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA4Q9HCM2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA4Q9HCM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms