Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDFQ9HBH1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDFQ9HBH1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms