Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1Q9H7V2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNDIG1Q9H7V2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms