Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNCQ9H7C4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCQ9H7C4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCQ9H7C4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218 ms