Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF2Q9H7B2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPF2Q9H7B2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPF2Q9H7B2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPF2Q9H7B2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms