Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C5orf42Q9H799 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf42Q9H799 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms