Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG1Q9H6L5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms