Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMOC1Q9H4F8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOC1Q9H4F8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOC1Q9H4F8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms