Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRDQ9H2X0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRDQ9H2X0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRDQ9H2X0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRDQ9H2X0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms