Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TNMDQ9H2S6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNMDQ9H2S6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms