Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM60Q9H2L4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM60Q9H2L4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM60Q9H2L4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms