Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRMDAQ9H2I8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRMDAQ9H2I8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms