Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL25Q9H0H3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL25Q9H0H3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms