Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 PLK3-205ENST00000476731 761 ntTSL 514.78□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-208ENST00000550316 545 ntTSL 514.6□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 514.6□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-205ENST00000549092 584 ntTSL 414.16□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 USP14-206ENST00000580410 474 ntTSL 414.14□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-206ENST00000485494 361 ntTSL 514□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-206ENST00000546782 541 ntTSL 313.94□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-211ENST00000526295 488 ntTSL 313.9□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 TTLL3-219ENST00000452597 603 ntTSL 413.81□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-207ENST00000637084 4622 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-215ENST00000551268 702 ntTSL 513.67□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CLCF1-202ENST00000533438 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 213.62□□□□□ -0.235e-19■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 213.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-203ENST00000534854 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 IFITM10-202ENST00000382123 3807 ntTSL 313.41□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 513.24□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 STX1A-206ENST00000462135 568 ntTSL 313.14□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 39.7
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XRN2Q9H0D6 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-220ENST00000531540 480 ntTSL 27.59□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 NNT-207ENST00000512422 754 ntTSL 37.44□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KDM4C-209ENST00000489243 1439 ntTSL 27.14□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-205ENST00000546726 580 ntTSL 36.8□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.93e-7■■■■■ 39.6
XRN2Q9H0D6 C9orf3-216ENST00000478603 802 ntTSL 227.52■■■□□ 21e-7■■■■■ 39.6
XRN2Q9H0D6 C9orf3-209ENST00000460573 443 ntTSL 525.93■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 39.6
XRN2Q9H0D6 C9orf3-217ENST00000479161 942 ntTSL 518■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 39.6
XRN2Q9H0D6 C9orf3-210ENST00000462125 961 ntTSL 315.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 39.6
XRN2Q9H0D6 C9orf3-204ENST00000424143 1605 ntTSL 214.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 39.6
XRN2Q9H0D6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.324e-6■■■■■ 39.5
XRN2Q9H0D6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 39.5
XRN2Q9H0D6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 39.5
XRN2Q9H0D6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.512e-8■■■■■ 39.5
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