Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD1Q9GZZ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms