Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM6Q9C030 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM6Q9C030 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM6Q9C030 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms