Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM8Q9BZR9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM8Q9BZR9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms