Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EDEM3Q9BZQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EDEM3Q9BZQ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EDEM3Q9BZQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms