Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A5Q9BY07 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A5Q9BY07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A5Q9BY07 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms