Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms