Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CECR2Q9BXF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
CECR2Q9BXF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CECR2Q9BXF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.8
CECR2Q9BXF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC45■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
CECR2Q9BXF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CECR2Q9BXF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CECR2Q9BXF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CECR2Q9BXF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CECR2Q9BXF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms