Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD2AQ9BW72 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD2AQ9BW72 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms