Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIFC1Q9BW19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIFC1Q9BW19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIFC1Q9BW19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIFC1Q9BW19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms