Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM109Q9BVC6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms