Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
WDR18Q9BV38 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR18Q9BV38 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR18Q9BV38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms