Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM43Q9BTV4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms