Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBGCP2Q9BSJ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBGCP2Q9BSJ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBGCP2Q9BSJ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms