Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT3Q9BQG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms