Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RETNLBQ9BQ08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RETNLBQ9BQ08 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms