Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPGQ9BPX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPGQ9BPX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms