Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN18Q99952 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPN18Q99952 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN18Q99952 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms