Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF6BQ99941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF6BQ99941 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF6BQ99941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms