Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID3AQ99856 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID3AQ99856 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms