Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL13Q99616 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL13Q99616 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL13Q99616 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms