Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF12Q99081 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF12Q99081 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCF12Q99081 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms