Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NODALQ96S42 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms