Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTAGE1Q96RT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTAGE1Q96RT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTAGE1Q96RT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms