Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms