Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A2Q96QD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC38A2Q96QD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms