Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPG4P5Q96PW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSPG4P5Q96PW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPG4P5Q96PW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms