Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD4LQ96PU5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4LQ96PU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms