Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCEEQ96PE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCEEQ96PE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCEEQ96PE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms