Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARAP1Q96P48 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ARAP1Q96P48 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ARAP1Q96P48 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
ARAP1Q96P48 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
ARAP1Q96P48 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARAP1Q96P48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.07■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ARAP1Q96P48 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ARAP1Q96P48 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ARAP1Q96P48 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms