Protein–RNA interactions for Protein: Q96NX9

DACH2, Dachshund homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DACH2Q96NX9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DACH2Q96NX9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DACH2Q96NX9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DACH2Q96NX9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms