Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC7Q96NW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LRRC7Q96NW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC7Q96NW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC7Q96NW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms