Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOX2Q96NM4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOX2Q96NM4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOX2Q96NM4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.7 ms